Порядок вычета НДС по оплате проезда работников к месту вахтовых работ и обратно тот же, что и по командировочным расходам.
Письмо Минфина от 5 сентября 2025 г. № 03-07-11/86955.
Согласно требованиям статьи 172 НК РФ, вычеты НДС производятся на основании счетов-фактур, выставленных продавцами при приобретении налогоплательщиком товаров (работ, услуг, имущественных прав) либо на основании иных документов в случаях, предусмотренных статьей 171 НК РФ. Вычет производится после принятия на учет указанных товаров (работ, услуг, имущественных прав) при наличии соответствующих первичных документов.
Суммы НДС, уплаченные по расходам на командировки, в том числе расходам по проезду к месту командировки и обратно, принимаемые к вычету при исчислении налога на прибыль, также принимаются также к вычету при исчислении НДС. При этом в книге покупок регистрируются заполненные бланки строгой отчетности или их копии с выделенной отдельной строкой суммой НДС, выданные работнику и включенные им в отчет о командировке.
Суммы НДС по расходам на командировки подлежат вычету, которые производятся на основании (п. 1 ст. 172 НК РФ):
При вахтовом способе работ НДС по расходам на услуги по перевозке работников к месту вахты и обратно принимается к вычету в порядке, аналогичном вычетам по командировочным расходам.
НДС следует принимать к вычету на основании бланков строгой отчетности с выделенной отдельной строкой суммой налога, в доле, соответствующей сумме оплачиваемых расходов, принятых к учету.

