Когда НДС могут доначислить расчетным методом?

В 2021 году ФНС провела выездную налоговую проверку ООО за период 2016–2018 годов. В ходе проверки компания не представила первичные документы, необходимые для исчисления налогов. Более того, при осмотре юридического адреса было установлено, что деятельность оно не ведет, а документацию скрывает.

В связи с невозможностью определить реальные налоговые обязательства из-за отсутствия учета, инспекция применила расчетный метод на основании пп. 7 п. 1 ст. 31 Налогового кодекса РФ, используя данные об аналогичных налогоплательщиках. Это привело к доначислению НДС в размере 13 791 714 рублей, а также соответствующих пеней (5,3 млн рублей) и штрафов. Впоследствии общество было признано банкротом.

Бывший директор общества, руководивший компанией на момент начала проверки, оспорил решение налоговой в суде. В первой инстанции ему удалось добиться успеха: суд признал решение инспекции недействительным, указав на то, что выбранные налоговым органом аналоги имеют разную численность, выручку и виды деятельности, а значит, не могут служить достоверным ориентиром для расчета.

Однако Пятнадцатый арбитражный апелляционный суд, а вслед за ним и окружная кассация, заняли противоположную позицию. Суды вышестоящих инстанций подчеркнули, что при применении расчетного метода бремя доказывания несоответствия расчетов лежит на налогоплательщике (или контролирующих его лицах), который своими действиями сделал точное исчисление налогов невозможным.

Кассационный суд согласился с выводами апелляции, указав на следующее. Первичная документация и бухгалтерская отчетность не были представлены ни налоговой, ни конкурсному управляющему. Доказательств их утраты по объективным причинам не представлено. Инспекция раскрыла принципы подбора аналогов по пяти критериям, включая вид деятельности по ОКВЭД и фактическое содержание операций по банковским выпискам (поступление средств за лифтовое оборудование). Заявитель не предложил свой вариант расчета или список более подходящих, по его мнению, организаций-аналогов. Различия в численности и выручке, по мнению суда, нивелируются при расчете средних показателей и не делают результат расчета произвольным. При расчете налога на прибыль применение тех же аналогов показало, что данные совпадают с отчетностью общества, что подтвердило корректность подхода.

Таким образом, решение налогового органа о доначислении НДС расчетным путем признано законным. Суд подтвердил, что в условиях сокрытия документов налоговый орган вправе определять обязанности налогоплательщика на основе имеющейся информации и данных об аналогичных компаниях.

Источник - постановление Арбитражного суда Северо-Кавказского округа от 11.02.2026 №А32-37221/2024.