Кто должен решать проблему «двойного НДС» в стройконтрактах?

Министерство финансов РФ в письме от 01.04.2026 № 03-07-11/26586 фактически самоустранилось от решения проблемы, с которой сталкиваются подрядчики при исполнении государственных контрактов в строительстве. Речь идет о ситуации, когда заказчики исключают из сметы НДС на отдельные виды работ и услуг, ссылаясь на положения Методики определения сметной стоимости (приказ Минстроя № 421/пр). Однако, по разъяснениям налоговых органов, подрядчик обязан уплатить НДС со всей суммы контракта, включая те затраты, которые, по мнению заказчика, не облагаются этим налогом.

В письме, направленном в Минфин, подрядчики указали, что при формировании сметы государственных контрактов заказчики исключают НДС на ряд услуг, которые освобождены от налогообложения в соответствии со статьей 149 Налогового кодекса РФ. Речь идет, в частности, о затратах на оформление банковских гарантий, на мероприятия по компенсации водным биологическим ресурсам, а также на плату за негативное воздействие на окружающую среду.

При этом положения Налогового кодекса (п. 1 ст. 154) устанавливают, что налоговая база по НДС определяется исходя из цены сделки без включения в нее налога, а сумма НДС предъявляется покупателю дополнительно к цене товаров (работ, услуг) . В соответствии с п. 1 ст. 168 НК РФ налогоплательщики обязаны предъявить покупателю сумму налога сверх цены реализуемых товаров.

Таким образом, подрядчик обязан исчислить и уплатить НДС с полной стоимости государственного контракта, однако в смете средства на уплату налога в отношении отдельных операций не заложены. Это означает, что подрядчик вынужден покрывать возникающую разницу за счет собственных средств, что нарушает его право на компенсацию всех издержек и получение вознаграждения, предусмотренное п. 2 ст. 709 Гражданского кодекса РФ.

В своем ответе специалисты  Минфина России отметили, что вопросы определения цены товаров (работ, услуг) в государственных контрактах положениями Налогового кодекса не регулируются.

Разъяснение Методики определения сметной стоимости строительства, утвержденной приказом Минстроя № 421/пр, находится вне компетенции Минфина России.

Таким образом, ведомство отказалось давать разъяснения по существу поставленного вопроса, указав, что его решение находится в ведении Минстроя России. Инициатива по внесению изменений в п. 181 Методики № 421/пр, предложенная в обращении, должна рассматриваться именно этим ведомством.

Таким образом, фактически Минфин подтвердил, что существующая практика формирования сметной стоимости государственных контрактов не соответствует налоговому законодательству, но посчитал, что исправлять это должен Минстрой России, а не финансовое ведомство.

Ранее Минстрой России в своих разъяснениях (письмо от 12.12.2025 № 77021-АВ/09) уже подтверждал, что расчет суммы НДС в соответствии с п. 181 Методики № 421/пр выполняется от итогов глав 1-12 сводного сметного расчета за исключением стоимости работ и услуг, не подлежащих налогообложению в соответствии со ст. 149 НК РФ . При этом изменение ставки НДС не является основанием для направления документации на повторную государственную экспертизу.

Следовательно, подрядчики, работающие по государственным контрактам, остаются в ситуации неопределенности: налоговые органы требуют уплаты НДС с полной суммы контракта, а заказчики при формировании сметы исключают часть средств на уплату этого налога. Единственным способом решения проблемы остается внесение изменений в Методику Минстроя, однако инициатива по их разработке должна исходить либо от самого ведомства, либо от участников рынка.