Правило округления сумм налога до полных рублей установлено пунктом 6 статьи 52 НК РФ. Оно применимо к большинству налогов, но не ко всем.
Пункт 6 статьи 52 НК РФ - не единственная норма в законодательстве. Рекомендации по округлению сумм налогов может содержать Порядок заполнения конкретной налоговой деклараций, расчета. Такие пояснения есть в отношении налога на прибыль, налога на имущество, акцизов, земельного и транспортного налогов.
В пункте 6 статьи 52 НК РФ говорится о порядке исчисления налогов, которые подлежат уплате в бюджет за период и отражаются в налоговых декларациях. Это дает право округлять НДС только в декларации. Суммы меньше 50 копеек отбрасываются, а сумма больше 50 копеек округляется до рубля.
Но для НДС, который указывается в счете-фактуре, предъявляемом продавцами покупателям, правило п. 6 ст. 52 НК РФ не применяется. Стоимостные показатели счета-фактуры нужно указывать в рублях и копейках. Это касается и книга покупок и продаж.
Стоимостные показатели счета-фактуры, в том числе в графе 8 «Сумма налога, предъявляемая покупателю», нужно указывать в рублях и копейках, как установлено в пункте 3 Правил заполнения счета-фактуры (утв. постановлением Правительства РФ от 26 декабря 2011 года № 1137).
О том, что не округляется до полных рублей сумма НДС, Минфин сообщал в письмах от 5 марта 2014 года № 03-07-15/9519, от 1 апреля 2014 года № 03-07-РЗ/14417 и от 17 февраля 2014 года № 03-07-09/6395.

