Если доработка российского ПО проводится в рамках договора по передаче исключительных прав, эти работы освобождаются от НДС.
Письмо Минфина от 6 мая 2026 г. № 03-07-07/37960.
Согласно подпункту 26 пункта 2 статьи 149 НК РФ, освобождаются от НДС услуги по передаче исключительных прав на программы, включенные в Единый реестр российских программ, а также прав на использование таких программ (включая обновления к ним и дополнительные функциональные возможности), в том числе путем предоставления удаленного доступа к ним через интернет.
Доработка (обновление) программы для электронных вычислительных машин освобождается от налога в случае, когда осуществляется в рамках договора (дополнительного соглашения к договору) на передачу прав на использование таких программ и баз данных.

