Минфин дал разъяснения для налогоплательщиков на упрощенной системе налогообложения (УСН), которые применяют льготные ставки НДС 5% или 7% при реализации жизненно необходимых и важнейших лекарственных препаратов (ЖНВЛП). Ведомство отвергло возможность определять налоговую базу по НДС исходя из торговой надбавки.
Финансисты напомнили об основных изменениях в законодательстве. С 1 января 2025 года организации и ИП на УСН признаны плательщиками НДС. При этом с 1 января 2026 года пороги для освобождения от уплаты НДС (статья 145 НК РФ) существенно ужесточены: 60 млн руб. за 2024 год, 20 млн руб. за 2025 год, 15 млн руб. за 2026 год и 10 млн руб. начиная с 2027 года. Если доходы «упрощенца» превысили эти суммы, он обязан исчислять и уплачивать НДС по общим правилам главы 21 НК РФ.
Однако главный вывод письма касается порядка расчета налоговой базы. В Минфине подчеркнули, что согласно пункту 1 статьи 154 НК РФ налоговая база при реализации товаров определяется как их стоимость, исчисленная исходя из рыночных цен (по статье 105.3 НК РФ), без включения в них НДС.
Никаких исключений для «упрощенцев», применяющих ставки 5% или 7%, либо для торговли жизненно важными лекарственными препаратами глава 21 НК РФ не содержит.
Определение налоговой базы «исходя из надбавки» (то есть только с суммы наценки, а не со всей отпускной цены) нормами Кодекса не предусмотрено.
Таким образом, организации и ИП на УСН, торгующие жизненно важными лекарствами и не имеющие освобождения от НДС, должны исчислять налог (5% или 7%) со всей стоимости реализованного препарата, а не только с торговой наценки. Иной подход, по мнению Минфина, противоречит действующей редакции Налогового кодекса.
Источник - письмо Минфина РФ от 11.03.2026 № 03-07-11/19265.

