Суд округа встал на сторону океанографического института в споре с налоговой инспекцией о безнадежной недоимке.
Суть разбирательства заключалась в следующем. Решением Арбитражного суда города Москвы от 17.09.2024 по делу № А40-78315/2024 задолженность учреждения по НДС за 1 квартал 2019 года в размере 7,3 млн рублей, а также соответствующие пени были признаны безнадежными к взысканию. Однако, по мнению заявителя, налоговый орган продолжал учитывать эту сумму при расчете совокупных налоговых обязательств, начисляя пени на уже списанную задолженность.
Институт обратился в суд с требованием признать незаконными действия инспекции, выразившиеся в неверном формировании сальдо ЕНС и начислении пеней.
Первая инстанция в удовлетворении иска отказала. Однако апелляция отменила это решение, полностью удовлетворив требования института.
Суд кассационной инстанции согласился с апелляцией. Важным аргументом стало нарушение налоговым органом очередности зачета единого налогового платежа, установленной пунктом 8 статьи 45 Налогового кодекса РФ. Суды установили, что внесенные учреждением денежные средства в размере более 6,3 млн рублей были необоснованно направлены на погашение недоимки, которую суд ранее признал безнадежной.
После вступления в силу судебного акта о признании задолженности безнадежной эти платежи должны были быть зачтены в счет уплаты совокупной обязанности налогоплательщика по другим налогам, сборам и пеням за иные периоды, что могло привести к образованию положительного сальдо на ЕНС института.
Таким образом, действия налогового органа были признаны незаконными, подтверждено право налогоплательщика на корректный перерасчет налоговых обязательств.
Источник - постановление Арбитражного суда Московского округа от 31.03.2026 №А40-62663/2025.

