При передаче прав на российское ПО применяется освобождение от НДС, причем независимо от вида договора.
Письмо Минфина России от 25 октября 2024 г. № 03-07-08/104517.
На основании подпункта 26 пункта 2 статьи 149 НК РФ не облагаются НДС:
Минфин отметил, что в целях применения освобождения от НДС вид договора на передачу прав на использование ПО в НК РФ не установлен. То есть освобождение применяется при передаче прав на основании лицензионных и смешанных договоров (например, когда услуги по техподдержке ПО непосредственно связаны с использованием программы, их стоимость включена в стоимость передаваемых прав и выделить ее из стоимости передаваемых прав невозможно).

