В письме ФНС России от 21.06.2024 № КЧ-4-9/7026@ «Обзор правовых позиций, сформированных ФНС России по результатам рассмотрения жалоб налогоплательщиков за 1 квартал 2024 года» приведена ситуация с начислением пени по уточненке за период моратория (п. пункт 1.5).
Компания подала в ИНФС налоговую декларацию по НДС одновременно с заявлением о применении заявительного порядка возмещения НДС. Сумма налога была возвращена дважды: сначала по заявлению в заявительном порядке, затем - по результатам камеральной налоговой проверки декларации. В результате у компании появилась сумма излишне возмещенного НДС.
За период с даты возврата НДС в заявительном порядке по дату погашения излишне возмещенного НДС были начислены пени. Все это относится к 2022 году, когда действовал мораторий. Пени компании успешно обжаловала в досудебном порядке.
Сумма НДС, излишне возмещенная на основании решения налоговой, признается недоимкой. На нее начисляются пени в соответствии со ст. 75 НК РФ.
Но, когда речь идет о 2022 годе, нужно помнить, в этот период действовал мораторий по постановлению Правительства РФ от 28.03.2022 № 497. А, согласно подп. 2 п. 3 ст. 9.1 Закона № 127-ФЗ следует, что на срок действия моратория (с 01.04.2022 по 01.10.2022) не начисляются неустойки, штрафы, пени.
Под мораторий в виде неначисления пеней попадает сумма непогашенной задолженности по основному долгу, день окончания налогового (отчетного) периода которой возник до 01.04.2022.
Начисление пеней на сумму недоимки в период действия моратория является необоснованным.
Еще по теме:
По какой ставке начисляют пени по налогам в 2024 году
В 2024 году вернулись к общему порядку начисления пеней по налогам

Доплата за ненормированный рабочий день входит в МРОТ
Реорганизация – не основание для увольнения главбуха
Какие данные берут налоговики для расчета НДС по средней выручке
Свидетель вправе отказаться от дачи ФНС показаний против самого себя
Работодатель сами обязан получать сведения об инвалидности работника
