Налоговую базу по НДФЛ можно уменьшить на сумму маткапитала

Плательщик при определении размера налоговой базы по НДФЛ имеет право на получение имущественных вычетов в суммах, полученных от продажи квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей (подп. 1, п. 1 ст. 220 НК РФ в редакции, действовавшей до 01.01.2014).
Вместо применения имущественного налогового вычета физлицо вправе уменьшить размер своего облагаемого дохода на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с его получением.
Таким образом, физлицо при продаже недвижимости, находившегося в собственности менее трех лет, может уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму расходов, связанных с приобретением этого имущества, в том числе произведенных за счет средств единовременной субсидии и (или) материнского капитала.
Эти разъяснения Минфин России изложил в письме от 10.07.2014 № 03-04-07/33669.