Уплата НДС

Ответ

Обособленное подразделение плательщиком налога не является. Обязанность по уплате НДС в полном объеме лежит на организации.  И налоговую декларацию нужно подавать в инспекцию по месту нахождения головного офиса. Сумму полученного аванса и сумму исчисленного с него НДС вам надо отразить в налоговой декларации по НДС за тот квартал, в котором был получен аванс. Отчитаться  необходимо не позднее 20-го числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом (п. 5 ст. 174 НК РФ), а уплатить - равными долями в течение трех следующих за отчетным кварталом месяцев, не позднее 20-го числа каждого из них (п. 1 ст. 174 НК РФ). База для расчета НДС к уплате — сумма полученного аванса, ставка — 18/118.  По мере реализации товаров (работ, услуг), в счет которой получен аванс,  НДС с полученных авансов принимается к вычету.
При получении аванса  ваша компания обязана выставить счет-фактуру. Сделать это необходимо не позднее пяти календарных дней со дня поступления аванса (п. 3 ст. 168 НК РФ). То же нужно делать и при отгрузке, в счет которой получен аванс.
По большому счету выставлять счета-фактуры — обязанность головной компании, раз уж структурная единица не признается плательщиком НДС. Однако поручить это делать  обособленному подразделению можно, поскольку правом подписи счета-фактуры обладают не только руководитель фирмы и главный бухгалтер, но и уполномоченные на то лица. Можно издать приказ по организации или выдать от ее имени доверенность кому-либо из работников подразделения. Печать на счета-фактуры не ставят.
Заполняйте счета-фактуры правильно. Они должны быть выставлены от имени головной компании. Наименование продавца пишется в соответствии с учредительными документами, проставляется ее ИНН, а вот  КПП — того подразделения, через которое происходит реализация.
В вашем случае главная задача — организовать со своим структурным подразделением документооборот и четкий обмен информацией, чтобы НДС, уплаченный с полученных авансов, по мере реализации принимать к вычету.